某日，一個(gè)巨大隕石掉落到了日本富士山附近。人類在隕石內(nèi)部發(fā)現(xiàn)了外星技術(shù)并設(shè)立了專門的機(jī)構(gòu)對(duì)其進(jìn)行解析。10年后的某日，外星人ワーキュリー到地球搶奪隕石，而同時(shí)人渣教師羽柴當(dāng)吉也在打隕石的主意，并強(qiáng)迫他的八個(gè)學(xué)生去啟動(dòng)隕石內(nèi)部的儀器，結(jié)果超級(jí)機(jī)器人ガクセイバー就由隕石中誕生了……ガクセイバー由腦波操縱，武器則都靠駕駛員自己的想象力來生成。在漫畫版中機(jī)體的顏色是藍(lán)，但由于OVA的主戰(zhàn)場(chǎng)是宇宙，為了能和背景對(duì)比而改成了紅色。